Nat. Commun. 速递：面向空间组学的两阶段对齐与拼接方法
研究领域：空间组学，多切片整合对齐，多尺度，动态图卷积神经网络董弘禹|作者论文题目：SANTO:acoarse-to-finealignmentandstitchingmethodforspatialomics论文来源：NatureCommunications论文链接：https://www.nature.com/articles/s41467-024-50308-x随着空间组学技术的蓬勃发展，对平面2D切片进行对齐与拼接，进而形成3D空间模型以发现全局特征，已成为空间组学分析中不可或缺的步骤。然而，现有
研究领域：空间组学， 多切片整合对齐， 多尺度， 动态图卷积神经网络
董弘禹 | 作者
论文题目：SANTO: a coarse-to-fine alignment and stitching method for spatial omics
论文来源：Nature Communications
论文链接：https://www.nature.com/articles/s41467-024-50308-x
随着空间组学技术的蓬勃发展，对平面 2D 切片进行对齐与拼接，进而形成 3D 空间模型以发现全局特征，已成为空间组学分析中不可或缺的步骤。然而，现有的方法在处理大规模空间组学数据集时面临挑战，尤其是基于荧光与图像技术产生的数据，在分析时往往耗时过多，分析结果也不尽准确。
鉴于此，来自阿卜杜拉国王科技大学和耶鲁大学的研究人员提出了一种针对空间组学的从粗到精的两阶段对齐策略—— SANTO。SANTO 分为两个阶段（图 1），首先在粗调阶段，通过计算相关系数快速匹配识别两切片重叠区域；随后在精调阶段，通过使用动态图卷积神经网络（DGCNN） 整合空间特征与基因表达特征，进一步对两切片进行精细化对齐。
图 1 SANTO 的算法示意图
研究者们通过广泛实验验证了 SANTO 相比现有方法的卓越性能。首先，他们在各种数据集上同已发表的各种方法实施了基准测评（图 2），测评结果展示 SANTO 在对齐任务与拼接任务的精确度和鲁棒性都超过了现有方法。
图 2 SANTO 与其他现有方法的基准测评比较
验证了 SANTO 模型的高性能后，研究人员使用此工具开展了丰富的下游应用。具体而言，他们对来自同一组织（乳腺癌样本）的跨平台的切片（10x Xenium 和 Visium）进行了对齐和拼接（图 3），确定了更多样化的细胞类型组成，并通过空间细胞通讯分析，更精细探索了肿瘤微环境，为临床治疗提供新的指导。
图 3 SANTO 成功拼接乳腺癌样本的跨平台切片，探索肿瘤微环境
研究人员进一步将模型应用于对齐三维时空组学数据，进而揭示组织发育进程。通过对齐两个小鼠胚胎样本（三维样本，分别为 E14.5 和 E15.5 时期，每个样本由连续 4 片二维切片构成），模型能够揭示肝、肺、心脏等器官的时空演化路径，有助于衰老和癌症进化的研究（图 4）。
图 4 利用 SANTO 实现 3D-to-3D 的时空对齐
最后，研究者们使用 SANTO 将基因表达和组蛋白测序两种模态的切片进行对齐，实现了跨模态整合，展现了 SANTO 能够进行多样广泛的对齐任务（图 5）。
图 5 利用 SANTO 实现跨模态对齐
总之，在本研究中，研究人员研发了一个通用框架—— SANTO，来解决空间组学的对齐和拼接问题。全面的基准测试揭示了模型在准确性，稳健性和可用性方面的卓越性能，通过跨平台拼接、3D-to-3D 时空对齐和跨模态对齐等任务，进一步展示了 SANTO 在各种具有挑战性的应用中的强大功能。
生命复杂性读书会招募中
集智俱乐部联合西湖大学理学院及交叉科学中心讲席教授汤雷翰，国家蛋白质科学中心（北京）副研究员常乘、李杨，香港浸会大学助理教授唐乾元，北京大学前沿交叉学科研究院研究员林一瀚，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心博士后唐诗婕，共同发起「生命复杂性：生命复杂系统的构成原理」读书会，从微观细胞尺度、介观组织器官尺度，到宏观人体尺度，梳理生命科学领域中的重要问题以及重要数据，希望促进统计物理、机器学习方法研究者和组学研究者之间的深度交流，建立跨学科合作关系，激发新的研究思路和合作项目。读书会从 2024 年 8 月 6 日开始，每周二晚 19:00-21:00 进行，持续时间预计 10-12 周。欢迎对这个生命科学、物理学、复杂科学、计算机科学深度交叉的前沿领域感兴趣的朋友加入！
3月28日，OPPOFind系列产品负责人周意保在微博发文，表示OPPO已经进入了5.5G时代。OPPOFindX7系列周意保在微博上传了一张截图，图中的手机锁屏界面右上方状态栏信号一栏显示为5GA，也就是人们更加熟悉的5.5G。此外，周意保也发文称："和大家一起进入5.5G新移动网络时代！"宣布了5.5G新移动网络时代的到来。OPPOFind系列产品负责人周意保微博有博主表示，OPPOFindX7系列即将行业首发支持5G-A（5.5G），OTA固件已经准备好了。5G-A理论上可以实现10倍提升的连接速率
西湖大学郭天南团队联合多家机构，收集近3000份人体组织样本，覆盖58种正常组织和25种癌症，对超1.3万种蛋白质定量分析，绘制出迄今分辨率最高的人体蛋白质组空间图谱。相关成果发表于《自然》，数据已公开。团队还开发了微量样本分析方法，识别出8940个差异表达蛋白和2879个肿瘤特异蛋白。
聊到小米CC9美图定制版的刷机，很多用户第一反应是“会不会变砖”“操作是不是很复杂”。其实，只要用对工具，整个过程远没有想象中那么吓人。线刷宝就是一款专为线刷而生的软件，无论你是想升级系统、恢复出厂设置，还是手机已经变砖需要救活，它都能提供比较完善的解决方案。而且，它不光支持小米，对很多其他品牌也都
对于小米CC9美图版的用户来说，如果遇到系统需要升级、或者手机变砖开不了机的情况，线刷往往是最稳妥的解决方案。而线刷宝这款工具，就是专门为这种场景设计的——它提供多种线刷模式，无论是想重装系统、恢复出厂设置，还是给手机“救砖”，都算得上是一个趁手的帮手。更重要的是，它不光支持小米，还覆盖了其他品牌，
前默克研究员TimCernak将人类药物研发能力转向保护化学，利用AI和自动化技术为青蛙、海龟等野生动物及受入侵物种威胁的铁杉树设计精准药物，旨在以现代化学手段应对物种灭绝危机。
华盛顿大学团队构建TheoremGraph，从arXiv提取1170万条定理陈述，利用Lean证明库获取388k形式化声明，通过slogan嵌入匹配和GPT-5.4裁决，确认47952对跨模态对应，有效连接非形式化与形式化数学知识，推动数学推理研究。
西伯利亚神经网络公司研究团队在arXiv发布预印本，测试了17个小模型在俄语RAG问答系统中的表现。结果表明，Qwen3系列小模型在答案质量上接近GPT-5-mini，且可在普通电脑CPU运行。但CPU推理速度较慢，实际应用需在速度与质量间取舍。
小米CC9美图定制版用了段时间，电池不耐用、耗电快，几乎是每个用户都会碰到的问题。想查查电池健康度、看看剩余容量到底还剩多少？其实MIUI系统里藏着好几个方法，不同版本对应不同入口，下面把几种靠谱的方式都捋一遍，跟着步骤走基本都能查到。 方法一：常见方法 如果你的手机是相对老版本的MIUI，可以这样
小米 CC9 美图版用久了，电池不耐用、耗电快，这都是难免的事。那怎么查看这块电池的真实健康状态和使用情况呢？针对不同版本的 MIUI 系统，这里整理了两个通用的查询方法，按步骤来，基本都能查到。 方法一：常见方法 第一个方法相对简单。对于比较老的 MIUI 系统，进入手机【设置】—【电量与性能】—
小米CC9美图版的BL锁，说白了就是Bootloader锁。Bootloader是Android系统启动前第一个跑起来的程序，它的核心职责就是验证加载对象签名——也就是说，它只允许官方认可的系统和Recovery启动，同时也拦住了Fastboot模式下的线刷操作。所以，但凡你想刷机，第一步就得先把这
火山引擎是字节跳动旗下企业级云与AI服务平台。聚焦大模型核心能力，依托字节自研豆包多模态大模型，凭借火山方舟一站式平台，提供模型精调、推理部署、智能应用搭建等全链路服务，结合高性能AI算力，助力各行业快速落地大模型数字化与智能化应用。
