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使用Perl编写脚本来实现滑动窗口,每次以1格的步长滑动,统计窗口内的数据

  发布于2025-01-30 阅读(0)

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用Perl语言写一个脚本实现滑动窗口比如窗口100格每次滑动1格统

用Perl语言写一个脚本实现滑动窗口比如窗口100格每次滑动1格统

use strict;

# $win_width: 窗口的宽度

# $pos: 当前窗口的位置,从1开始,$DNA_len-$win_width+1结束

# $DNA: DNA序列

my $DNA="agtgatgatagtagatagatagtataatagatagatagatatatgatagatagataaggaatagaagta";

my $win_width=10;

for(my $i=0;$i

print calc($DNA,$win_width,$i+1)."\n";

}

sub calc{

my ($DNA,$win_width,$pos)=@_;

$DNA=~s/\s+//g;

$DNA=uc($DNA);

if($DNA=~/[^ATGC]/){

print "非法字符";

return;

}

my $sub_DNA=substr($DNA,$pos-1,$win_width);

my @atgc=split("",$sub_DNA);

my %atgc; #atgc含量

map{$atgc{$_}++}@atgc;

return sprintf("%.2f",($atgc{"G"}+$atgc{"C"})/$win_width);

}

字符串匹配里面的滑动窗口是什么意思

滑动窗口的概念

滑动窗口(Sliding window)是一种流量控制技术。早期的网络通信中,通信双方不会考虑网络的拥挤情况直接发送数据。由于大家不知道网络拥塞状况,同时发送数据,导致中间节点阻塞掉包,谁也发不了数据,所以就有了滑动窗口机制来解决此问题。参见滑动窗口如何根据网络拥塞发送数据仿真视频。图片是一个滑动窗口的实例:

滑动窗口协议是用来改善吞吐量的一种技术,即容许发送方在接收任何应答之前传送附加的包。接收方告诉发送方在某一时刻能送多少包(称窗口尺寸)。

TCP中采用滑动窗口来进行传输控制,滑动窗口的大小意味着接收方还有多大的缓冲区可以用于接收数据。发送方可以通过滑动窗口的大小来确定应该发送多少字节的数据。当滑动窗口为0时,发送方一般不能再发送数据报,但有两种情况除外,一种情况是可以发送紧急数据,例如,允许用户终止在远端机上的运行进程。另一种情况是发送方可以发送一个1字节的数据报来通知接收方重新声明它希望接收的下一字节及发送方的滑动窗口大小。

滑动窗口的机制

滑动窗口协议的基本原理就是在任意时刻,发送方都维持了一个连续的允许发送的帧的序号,称为发送窗口;同时,接收方也维持了一个连续的允许接收的帧的序号,称为接收窗口。发送窗口和接收窗口的序号的上下界不一定要一样,甚至大小也可以不同。不同的滑动窗口协议窗口大小一般不同。发送方窗口内的序列号代表了那些已经被发送,但是还没有被确认的帧,或者是那些可以被发送的帧。

下面举例说明,假设发送窗口尺寸为2,接收窗口尺寸为1:

分析:①初始态,发送方没有帧发出,发送窗口前后沿相重合。接收方0号窗口打开,等待接收0号帧;②发送方打开0号窗口,表示已发出0帧但尚确认返回信息。此时接收窗口状态不变;③发送方打开0、1号窗口,表示0、1号帧均在等待确认之列。至此,发送方打开的窗口数已达规定限度,在未收到新的确认返回帧之前,发送方将暂停发送新的数据帧。接收窗口此时状态仍未变;④接收方已收到0号帧,0号窗口关闭,1号窗口打开,表示准备接收1号帧。此时发送窗口状态不变;⑤发送方收到接收方发来的0号帧确认返回信息,关闭0号窗口,表示从重发表中删除0号帧。此时接收窗口状态仍不变;⑥发送方继续发送2号帧,2号窗口打开,表示2号帧也纳入待确认之列。至此,发送方打开的窗口又已达规定限度,在未收到新的确认返回帧之前,发送方将暂停发送新的数据帧,此时接收窗口状态仍不变;⑦接收方已收到1号帧,1号窗口关闭,2号窗口打开,表示准备接收2号帧。此时发送窗口状态不变;⑧发送方收到接收方发来的1号帧收毕的确认信息,关闭1号窗口,表示从重发表中删除1号帧。此时接收窗口状态仍不变。

若从滑动窗口的观点来统一看待1比特滑动窗口、后退n及选择重传三种协议,它们的差别仅在于各自窗口尺寸的大小不同而已。1比特滑动窗口协议:发送窗口=1,接收窗口=1;后退n协议:发送窗口>1,接收窗口=1;选择重传协议:发送窗口>1,接收窗口>1。

滑动窗口流量控制

TCP的特点之一是提供体积可变的滑动窗口机制,支持端到端的流量控制。TCP的窗口以字节为单位进行调整,以适应接收方的处理能力。处理过程如下:

TCP连接阶段,双方协商窗口尺寸,同时接收方预留数据缓存区;

发送方根据协商的结果,发送符合窗口尺寸的数据字节流,并等待对方的确认;

发送方根据确认信息,改变窗口的尺寸,增加或者减少发送未得到确认的字节流中的字节数。调整过程包括:如果出现发送拥塞,发送窗口缩小为原来的一半,同时将超时重传的时间间隔扩大一倍。

滑动窗口机制为端到端设备间的数据传输提供了可靠的流量控制机制。然而,它只能在源端设备和目的端设备起作用,当网络中间设备(例如路由器等)发生拥塞时,滑动窗口机制将不起作用。

C数组滑动滑动窗口

队列么?.NET原生支持的.

Queue q = new Queue(10);//10 个队列,FIFO

for (int i = 0; i != 10; i++)

{

q.Enqueue(i);//先填满10个.

}

if (q.Count == 10)//如果填满了

{

q.Dequeue();//第一个出队列,如果不出队列,count就会变成11

q.Enqueue(10);//进队列,Count仍保持10

}

Queue q = new Queue();//类似的还有LIFO,NET中的实现是Stack,Pop弹栈和Push压栈

for (int i = 0; i != 100; i++)

{

if (q.Count == 10)//超过10个出队列

{

q.Dequeue();

}

q.Enqueue(i);

}

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