利用R语言解压与压缩.tar.gz.zip等格式文件

最近在处理文件时，发现R语言在批量解压与压缩方面相当顺手，这里把不同格式的常用操作方法整理出来，方便直接查阅。 由于解压和压缩本质上是对称的操作，所以下面以解压为例，按文件格式逐一说明。

.zip

压缩用 `zip()`，解压用 `unzip()`。 压缩时，第一个参数指定压缩后的文件名，第二个参数指定要压缩的文件名。 解压就更简单了，直接在 `unzip()` 里写上需要解压的文件名即可。

.tar.gz

压缩：`tar()`，解压：`untar()`。 用法和 `.zip` 完全一致，不再赘述。

.gz 与 .bz2

这两种格式比较特殊——它们既可以视为压缩文件，也可以直接当作数据文件来读取，因为本质上就是数据文件本身。下面从“解压”和“直接读取”两个角度来介绍。

1) 直接解压

R 默认没有解压这类文件的函数，需要借助 `R.utils` 包。调用 `gunzip()` 或 `bunzip2()` 即可解压，注意函数里有一个 `remove =` 参数：设为 `TRUE` 时，只保留解压后的文件，原压缩包会被自动删除（默认就是 `TRUE`）。 ```bash library(R.utils) gunzip("file.gz", remove = TRUE) bunzip2("file.bz2", remove = TRUE) ``` 解压之后，直接用 `read.table()` 就能读取。

2) 直接读取

如果目的只是读取数据而非保留解压后的文件，可以用两个默认函数组合的方式： ```bash dat <- read.table(gzfile("file.gz")) ``` 对于 R 2.10 及以上版本，还有更简洁的方式——直接 `read.table()` 就能读取压缩文件： ```bash dat <- read.table("file.gz") ```

参考

- Decompress gz file using R - untar: Extract Or List Tar Archives