EndNote删除重复文献教程：查重、比对与合并保留步骤

在整理文献库时，重复导入是常见问题。直接批量删除风险极大，因为不同来源的同一篇文章可能在作者拼写、年份或附件上存在差异。EndNote 提供的查重功能并非一键自动合并，而是通过并排比对窗口，让你人工判断哪条记录更完整、哪条已被论文引用。按照以下顺序操作，可以在清理冗余数据的同时，确保现有 Word 文档中的引用不丢失。

EndNote 主界面，左侧为 All References 分组，顶部为 Library 菜单入口

必要的准备只有一个：确保你使用的是 Windows 桌面版 EndNote，并且当前打开的是需要整理的 .enl 文献库文件。

1. 先备份当前文献库

在执行任何批量删除或移动操作前，必须建立独立的安全副本。同步功能不是备份，一旦在本地清空回收站并同步，删除操作可能会同步到在线库，导致数据无法恢复。

点击顶部菜单栏的【File】，选择【Compress Library (.enlx)】（部分旧版本显示为 Compressed Library）。在弹出的对话框中，建议勾选包含文件附件和全部记录，将生成的 .enlx 压缩包保存到与工作库不同的文件夹中。如果库文件过大导致压缩失败，请使用操作系统自带的复制粘贴功能，直接拷贝整个 .enl 文件和对应的 .Data 文件夹作为备份。

1. 先备份当前文献库

2. 对整个库运行查重

备份完成后，回到主界面。点击左侧面板顶部的【All References】，确保查重范围覆盖整个库，而不是某个临时分组。

点击顶部菜单栏的【Library】，在下拉菜单中选择【Find Duplicates】。软件会根据默认规则（通常包括文献类型、作者、年份、标题等字段）扫描全库。

Find Duplicates 弹出的并排比较窗口，左右两侧显示疑似重复的文献详情

扫描结束后，系统会弹出一个并排比较窗口，左侧显示第一条疑似重复记录，右侧显示第二条。注意，这只是一个“疑似”列表，标题相似但 DOI 不同的文章可能被误判，而字段差异较大的同一篇文章也可能漏判。因此，这个窗口是核对起点，而非最终删除清单。

3. 补齐信息后选择保留记录

在比较窗口中，仔细对比两条记录的 Author（作者）、Year（年份）、Title（标题）、Journal（期刊）以及 DOI。如果发现其中一条记录缺少摘要或 PDF 附件，而另一条完整，不要急于点击保留。

正确的做法是：先将不完整记录中有价值的字段（如笔记、特定格式的引用信息）手动复制并粘贴到准备保留的那条记录中。确认所有必要信息都已整合到一侧后，再点击该侧下方的【Keep This Record】按钮。

确认信息整合后，点击保留记录一侧的 Keep This Record 按钮

被舍弃的记录会自动移入【Trash】（回收站）。如果当前无法判断哪条更好，或者担心误删，请点击【Skip】跳过这一组。跳过的记录不会立即删除，你可以稍后再次检查。切勿为了追求速度而盲目点击保留，尤其是当某条记录已在 Word 中被引用时。

4. 检查剩余重复项和论文引用

当所有疑似重复组都处理完毕（即比较窗口不再弹出），点击窗口右上角的关闭按钮。此时，被跳过的记录仍留在库中，被舍弃的记录在 Trash 里。

接下来是关键验证步骤：打开你正在写作的 Word 文档，刷新参考文献列表。检查是否有引用标记变成了问号或丢失了信息。这是因为 EndNote 的引用是通过记录的唯一 ID 关联的，如果你保留的记录 ID 与被删除的不同，Word 可能无法自动更新指向。

Word 文档中 EndNote 插件栏，显示 Update Citations and Bibliography 按钮

如果发现引用异常，需要在 Word 中使用 EndNote 插件的“Update Citations and Bibliography”功能重新关联，或者在 EndNote 中找回被误删的记录。确认所有论文引用正常、保留的记录字段完整且无冗余后，才可以右键点击【Trash】选择【Empty Trash】永久删除垃圾记录。至此，文献库的查重与清理工作才算安全完成。